一般来说，在研究实施后，就要围绕研究主题着手收集并积累相关材料，然后根据相关的统计学方法进行整理，以便后续的分析研究。对于医学研究论文而言，材料收集与整理是撰写高质量论文的重要条件，但论文材料来源于科学的课题设计和恰当的实验方法，所以研究的科学性、创新性、合理性才是完成高质量论文的基础。医刊汇编译指出，医学研究资料收集与整理的基本要求有：真实、系统、完整、典型、新颖，同时要符合 伦理学的要求。
1.材料的真实是对论文资料最基本的要求，只有从真实的资料中才能发现其蕴含的内在规律，若是从不真实的材料或随意编造的数据中总结规律，得出的结论必然是错误的，这种错误不仅无助于临床决策，还有可能导致临床决策失误，进而威胁患者生命安全。因而要尊重事实，从真实的资料着手科学研究。
2.医学研究的对象通常是复杂并相互联系的，这就要求反映研究对象的资料有系统性和完整性，才能从整体上揭示事物的本质和规律，才能对研究对象有较深刻的认识。系统和完整不仅指研究样本的数量要达到统计学要求，而且每个样本的信息也必须全面，不能遗漏项目，否则可能使统计结果出现偏差，导致错误结论。
3.材料必须符合论文主题的要求并具有较强的代表性和说服力，所以选用的材料要有典型性，要善于从众多繁杂的材料中选取具有代表性的材料。
4.创新性是研究者创造性劳动的体现，所以在收集材料时要特别注意对新发现、新思路的及时记录；并要广泛收集文献材料，从中选取能反映新进展、新成果的新材料，将这些具有新颖性的材料纳入论文之中。
5.医学研究的目的在于促进人类对疾病的认识水平，进而提高诊疗水平，改善人类生存状态。医学科研的目的是为了维护和增进人类健康和造福于人类，因而医学科研不同于其他学科科研活动的关键在于，它总是直接或间接地为人的生命和缝康利益服务，所以不管医学科研工作者是否意识到，整个医学科研活动都会始终在人类道德天平上，接受道德检验。
因此科学研究应注重研究对象的利益、符合伦理，在进行人体或动物的生物医学研究时，要经过相关医学伦理委员会的审查，以维护研究活动参与者的尊严、权利和安全。在收集资料时应向研究对象说明来意，征得同意后才能开始收集资料；当研究涉及个人隐私时，更要尊重研究对象的要求。
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