讨论部分是作者将自己的研究过程及成果与读者进行互动的一个过程，是医学论文的重要内容之一。通常来说，一篇好的论文，讨论部分要占到论文的三分之一。国际医学期刊编辑委员会(ICMJE)关于医学论文讨论部分所提要求，将其归纳为下列5点：
1、重点讨论研究中新的和重要的发现引出的结论。对引言或结果部分已提出的数据和资料不要重复。
2、对于试验性研究，先对主要结果作简要总结，探究导致这些结果的可能机理;将结果与其他相关研究进行比照;说明研究的局限性;探索结果对行业未来趋势和临床实践的意义;如有充实的证据，可陈述新的假设，并清楚表明这些是新假设。
3、作者应将结果和研究目的结合起来讨论，避免没有资料依据的陈述和结论。
4、避免作出关于经济效益和成本方面的叙述。
5、论文中避免作出“最先发表”的声明，也不要提及尚未完成的工作。
对于一般的病例报告、病例分析或临床经验总结等稿件，其讨论部分主要是对临床资料进行分析和论述，提供有价值的经验或结论，同样应参考执行上述有关讨论的具体要求。对通过随访所取得的疗效结果，要实事求是作出客观评价，不夸大成果，不避讳缺点。讨论应有重点次重点分明、条理清晰、层次分明。文句则力求简洁明了。讨论部分的长短，虽然没有明确规定，一般约占全文的1/4到1/3篇幅。
